一、存栏量明显减少
　　前几年，通过炒种养殖带来的负面效应已经显现，少数人确实发了财，但大多数养羊户赔了本，五、六千元一只的羊仅卖了七、八佰元，许多养羊户不得不忍痛卖掉，一时间饲养量明显减少，尤其是以山羊最为明显。
　　负面效应不仅表现在经济上，更多地是使人们对发展养羊失去了信心，也使养羊业的发展失去了后劲，原先养羊户中不乏有年轻人，但现在放羊的大多数是60岁左右的人，随着这些人年龄的增大，养羊户在逐年减少，数量规模也相应变小，并且显现出后继无人的发展趋势。

　　二、品种混杂，性能退化
　　近几年，通过引进波尔山羊、无角多赛特等品种进行改良，虽然目的是好的，但在实施过程中，没有很好地按照《种畜禽管理条例》去执行，出现了炒种热，良种得不到良养，发挥不出改良优势，同时也失去了对当地自然条件的适应性，还不如饲养一些原始的当地品种，偏离了改良方向。
　　原来品种的一些优良生产性能如发情早、好配种、多胎、耐粗饲、抗病能力强等也明显退化，当地品种资源受到侵害，造成了现在养的山羊和绵羊很难说是什么品种，破坏了生物的多样性，增加了流行病发生的危险。

　　三、管理方式粗放，经营水平低下
　　近年来，各地虽然建了不少养殖小区，但是利用率较低，养羊方式仍以家庭为单位放牧为主，卫生条件差、环境污染严重，饲养者年龄较大，文化水平低，靠老经验养殖，接受新知识能力慢，新技术应用较少，致使羊群呈现“秋肥冬瘦春死”的状况，发现羊只有病后简单打上几针，不见效就随意处理掉，不报告兽医管理部门，这样一方面在临床上很少积累到治疗经验，培养不出高水平的畜牧兽医人才，更不利于畜牧科技的发展。现在专业教科书上的一些数据大多是十年前的研究成果，与现在的畜牧业发展形式很不适应；另一方面也使有病的畜产品流向市场，为养殖业的发展埋下了隐患。

　　四、饲草短缺，疾病增多
　　随着国家对农业的重视，取消农业税、加大对农业的扶持力度，各地开发投入加大，原先可以放牧的沟头坝岭、盐碱荒地被利用起来，天然草场减少；种植小麦、玉米效益增加，牧草种植亩数减少，加上作物还田，秸秆利用率低，这又减少了一大饲草来源；化学灭草剂的应用，田间杂草减少，相比而言，由于化学药物的广泛应用和环境污染的日益严重，影响羊生长发育的病因增多，普通病发病率增高，少数灭绝的传染病又有死灰复燃的迹象，寄生虫病呈高发态势。草少、病多成为制约养羊业发展的两大难题。